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Welche Lebensräume findet man im und am See? Biologisch betrachtet, unterscheidet man zwei wichtige Zonen als Lebensraum von Tieren und Pflanzen: Die Bodenzone (Benthal) und den freien Wasserkörper (Pelagial). Tiere und Pflanzen, die am oder im Seeboden wohnen oder wachsen, bezeichnet man als Benthos. Die Bewohner des Freiwasserbereichs werden als Plankton (bis 2 cm) oder als Nekton bezeichnet. Die Bodenzone gliedert sich nach den Lichtverhältnissen in einen hellen und dunklen Bereich. Der helle, obere Bereich kann von Pflanzen besiedelt sein und wird als Uferzone (Litoral) bezeichnet. Den tieferen, lichtlosen Teil, auf dem keine Pflanzen wachsen, nennt man Tiefenzone (Profundal). Die beiden Bereiche trennt die Sprungschicht. Die Uferzone erfüllt wichtige ökologische Funktionen. Sie umfasst die bei hohen Wasserständen überflutete Zone, die Flachwasserzone und die Uferbank. Den direkten Übergang zwischen Wasser und Land bildet die Röhricht- oder Schilfzone. Der Bereich, der im flachen Wasser auf die Röhrichtzone folgt, heisst Schwimmblattpflanzenzone.
Die Pflanzen erreichen mit ihren Blättern die Wasseroberfläche. Als nächstes schließen sich Pflanzen der Unterwasserpflanzenzone an, die völlig unter der Wasseroberfläche wachsen. Die nächst tieferen Bereiche bis zur Sprungschicht können nur noch von Pflanzen besiedelt werden, die an die vorherrschenden Licht- und Wasserdruckverhältnisse angepasst sind. Das sind Armleuchteralgen, die hier "Unterseeische Wiesen" bilden (nur in nährstoffarmen Seen). Ab der Sprungschicht beginnt die Tiefenzone, in der kein pflanzliches Leben mehr möglich ist. Der Freiwasserbereich wird nach der Tiefe, in die das Licht noch eindringen kann, unterteilt. Man unterscheidet eine lichtdurchflutete Nährschicht (trophogene Zone) in der durch Photosynthese mehr Nährstoffe gebildet als verbraucht werden und eine Zehrschicht (tropholytische Zone), die unbelichtet ist und in der keine Biomassenproduktion durch Photosynthese stattfindet. Die Kompensationsschicht trennt die beiden Bereiche voneinander. Hier herrschen ausgeglichene Verhältnisse zwischen Auf- und Abbau vor.
Im Litoral mit seinem Pflanzenbewuchs leben die meisten Tierarten. Die Bandbreite umfasst alle wichtigen Tiergruppen von Einzellern bis zu Säugetieren. Im Profundal, in der dunklen pflanzenlosen Tiefe des Seegrundes, leben Bakterien und wirbellose Tiere von herabsinkendem organischen Material. Das Pelagial ist Lebensraum von Fischen und Plakton. Die im Wasser schwebenden Algen sind das sogenannte Phytoplankton. Mikroskopisch kleine Organismen wie z. B. Kleinstkrebse nennt man Zooplankton. Thermische Schichtung Im freien Wasserkörper des Sees entstehen aufgrund der Licht- und Temperaturverhältnisse im Sommer unterschiedliche Lebensräume. Durch Sonneneinstrahlung entsteht eine stabile thermische Schichtung des Wassers. Es entstehen chemisch-physikalisch und biologisch stark getrennte Einheiten. Aufgrund von Dichteunterschieden durchmischt sich das erwärmte Oberflächenwasser (Epilimnion) nicht mit dem kälteren Tiefenwasser (Hypolimnion). Zwischen diesen beiden Schichten liegt die Sprungschicht (Metalimnion), innerhalb dieser die Temperatur stark fällt und die Dichte des Wassers entsprechend zunimmt.
Pflanzen am und im Wasser Die Pflanzen im und am Wasser bilden zusammen mit der Tierwelt eine Lebensgemeinschaft, die für den Bestand des Gewässers von großer Bedeutung ist. In nährstoffreichen Seen und Weihern treten im Uferbereich typische Zonen bestimmter Pflanzenarten auf. Nähert man sich einem See, gelangt man über den Bruchwald, der meist aus Erlen besteht, zu den Weidengebüschen. In der nächsten vorgelagerten Zone findet man im Großseggenried vor allem Seggen, die zu den Sauergräsern gehören. Bereits im Wasser stehen die Pflanzen des Röhrichts. Hier dominiert das Schilfrohr, aber auch Rohrkolben, Binsen und Pfeilkraut kommen vor. Das Röhricht ist ein unverzichtbarer Lebensraum für viele Vögel und Tierarten, beispielsweise für den Teichrohrsänger, der ein Hängenest aus Schilfrohr baut. Das Röhricht stellt ein natürlicher Schutz gegen Wellen und den Abbau von Uferland dar. Außerdem reinigt es das Wasser von Giftstoffen. Es beschleunigt aber auch die Verlandung des Sees, wenn zu viele Nährstoffe im Wasser vorhanden sind.